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Sull'origine del toponimo Pergine esistono varie ipotesi interpretative, di alcune delle quali si dà qualche cenno.

Nel Settecento Giuseppe Andrea Montebello ritiene che derivi dal nome del torrente Fèrsina, cui assegna la derivazione da ferrugo o ferri sinus perché attraversa una zona ricca di miniere di ferro; dal nome del torrente ci sarebbe stato il passaggio a Persina e poi a Pergine. Tale idea fu ripresa da Francesco de Tecini che parla di Fersen come nome comune al torrente e al sito. Anche Tommaso Vigilio Bottea riporta la stessa opinione sulla interrelazione tra il luogo e il corso d'acqua, ma tale ipotesi, allo stato attuale delle ricerche, appare ormai superata.

Secondo Bartolomeo Malfatti, Pergine è una forma locativa di Pergo, luogo elevato, rocca: perg forse parallelo di Berg (monte). La stessa ipotesi è condivisa anche da Paolo Orsi e da Cesare Battisti. Quest'ultimo accetta anche la derivazione dalla voce Pyrgus, da cui l'italiano pergamo e pergus, poggio.

Per Ernesto Lorenzi appare probabile la derivazione da Pergamo, altura.

Renè Preve Ceccon infine, che ha recentemente studiato l'origine del nome di Pergine, pur asserendo che si tratta di una questione ancora aperta, sembra preferire la derivazione da colle-altura, collegata all'esistenza di un fortilizio. Ci sono poi una serie di studi sul toponimo Pergine, riferiti all'altra comunità che ha lo stesso nome, Pergine Valdarno in provincia di Arezzo: nel secolo scorso G.F. Gamurrini faceva risalire il nome ad una lingua primitiva, forse quella dei Liguri, i quali avrebbero influenzato il mondo degli Etruschi ai quali anche Silvio Pieri ricollega il toponimo.

Verso la metà del nostro secolo Giacomo Devoto ipotizza che Pergine derivi dal termine Perga-Parga, al quale assegna il significato di fienile, capanna. Per Giovanni Semerano i toponimi con suffisso in -ine sono di origine orientale o etrusca e indicano una fonte d'acqua: Pergine deriverebbe secondo questa ipotesi da Perku-ine = sorgente sul colle.

A tutt'oggi non è comunque possibile stabilire quali fattori accomunino le due località per quanto riguarda l'origine del nome.

Tratto da: Claudio Morelli, Salvatore Piatti, Jole Piva, Marta Scalfo, "Guida di Pergine Valsugana", Pergine Valsugana (Trento) 1995, pagina 15.